Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms