Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf38Q5JPI3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C3orf38Q5JPI3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms