Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDLIM3Q53GG5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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