Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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