Protein–RNA interactions for Protein: Q32MK0

MYLK3, Myosin light chain kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYLK3Q32MK0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MYLK3Q32MK0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms