Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGSM1Q2NKQ1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms