Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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