Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GEN1Q17RS7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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