Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CDO1Q16878 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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CDO1Q16878 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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CDO1Q16878 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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