Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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