Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NDUFA9Q16795 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NDUFA9Q16795 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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