Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HLFQ16534 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HLFQ16534 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HLFQ16534 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HLFQ16534 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HLFQ16534 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms