Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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DDB1Q16531 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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