Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms