Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1Q15904 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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