Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SCN9AQ15858 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SCN9AQ15858 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SCN9AQ15858 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SCN9AQ15858 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SCN9AQ15858 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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