Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEC23BQ15437 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms