Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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