Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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