Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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TRIM29Q14134 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM29Q14134 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM29Q14134 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TRIM29Q14134 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM29Q14134 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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