Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TUBA3CQ13748 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBA3CQ13748 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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