Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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