Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PMS2P3Q13401 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PMS2P3Q13401 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMS2P3Q13401 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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