Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SKP2Q13309 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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