Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFCP2Q12800 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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