Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms