Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms