Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
CD164Q04900 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms