Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PPARDQ03181 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms