Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms