Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms