Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMF1P82094 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMF1P82094 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMF1P82094 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMF1P82094 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMF1P82094 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMF1P82094 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms