Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCL8P80075 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms