Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HBBP68871 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HBBP68871 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms