Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-24P63145 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms