Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ERVFRD-1P60508 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms