Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BGRP55822 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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