Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms