Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PGGT1BP53609 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP53609 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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