Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms