Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTBP49356 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms