Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD97P48960 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD97P48960 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD97P48960 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms