Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms