Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD8P48556 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms