Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP214P35658 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms