Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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HOXD10P28358 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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HOXD10P28358 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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HOXD10P28358 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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HOXD10P28358 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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