Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTX3P26022 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTX3P26022 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms