Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMA1P25391 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms