Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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MMP11P24347 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MMP11P24347 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MMP11P24347 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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