Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPREP23469 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPREP23469 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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